Phương pháp dựa trên kính hiển vi

Các hợp chất hoạt tính sinh học gây ra những thay đổi kiểu hình trong các tế bào đích, những thay đổi có thể quan sát được bằng kính hiển vi và có thể cung cấp cái nhìn sâu sắc về cơ chế hoạt động của hợp chất.[13] Với các đại lý kháng khuẩn, ví dụ, việc chuyển đổi của các tế bào mục tiêu để spheroplasts có thể là một dấu hiệu cho thấy peptidoglycan tổng hợp đang được nhắm mục tiêu, và filamentation của các tế bào mục tiêu có thể là một dấu hiệu cho thấy FtsZ hoặc DNA đang được nhắm mục tiêu.[4] Trong trường hợp tác nhân chống ung thư, sự hình thành bleb có thể là một dấu hiệu cho thấy thuốc đang phá vỡ màng plasma.[14] Một hạn chế hiện tại của phương pháp này là thời gian cần thiết để tự tạo và giải thích dữ liệu, nhưng những tiến bộ trong kính hiển vi và phần mềm phân tích hình ảnh tự động có thể giúp giải quyết vấn đề này.[4][13]

Phương pháp sinh hóa trực tiếp

Các phương pháp sinh hóa trực tiếp bao gồm các phương pháp trong đó một protein hoặc một phân tử nhỏ, chẳng hạn như một ứng cử viên thuốc, được dán nhãn và được truy tìm khắp cơ thể.[15] Điều này chứng tỏ là cách tiếp cận trực tiếp nhất để tìm protein mục tiêu sẽ liên kết với các mục tiêu quan tâm nhỏ, chẳng hạn như đại diện cơ bản của phác thảo thuốc, để xác định dược điển của thuốc. Do các tương tác vật lý giữa phân tử được dán nhãn và protein, phương pháp sinh hóa có thể được sử dụng để xác định độc tính, hiệu quả và cơ chế tác dụng của thuốc.